Turgelių bažnyčios vizitacijoje 1830 m. minima dabartinės Akmenynės seniūnijos vietoje buvusi unitų bažnyčia bei kunigas. 1928 m. pastatyta dabartinė medinė bažnyčia. 1945 m. įkurta parapija. Bažnyčia įdomi architektūriniu požiūriu. Fasadinėje pusėje turi išsikišusį keturkampį bokštą. Jame yra pagrindinės durys į pastatą.  Akmenynės Šv. Kūdikėlio Jėzaus Teresės bažnyčioje yra keli dailės paminklai.